區(qū)內(nèi)共有野生動物1555種,其中鳥類296種。國家一級重點保護鳥類有丹頂鶴、白頭鶴、白鶴、大鴇、東方白鸛、黑鸛、金雕、白尾海雕、中華秋沙鴨、遺鷗10種,國家二級保護鳥類有灰鶴、白枕鶴、大天鵝、小天鵝、白琵鷺等49種。
區(qū)內(nèi)共有種子植物393種,其中野生種子植物116種。天然蘆葦2.7萬公頃,天然草地1.2萬公頃,是中國沿海最大的新生濕地自然植被區(qū)。
黃河口地形地貌和獨特的自然資源形成了以“奇、特、曠、野、新”為主要美學特征的自然景觀和生態(tài)旅游資源。