朱镕基在會晤中講話指出，“上海合作組織”的成立正在對當今國際和地區(qū)的局勢產(chǎn)生重要而深遠的影響。首次總理會晤的任務就是要具體落實上海峰會的決議和精神。六國已在政治、安全和外交等領(lǐng)域開展了卓有成效的合作，建立了會晤和磋商機制。就健全“上海合作組織”的運行機制而言，當前應重點抓好兩項工作：一是盡快著手制定《上海合作組織憲章》，以做到有章可循，有法可依；二是抓緊建立比什凱克反恐怖中心，以使我們在聯(lián)合打擊恐怖主義、分裂主義和極端主義的行動中，既有法律基礎(chǔ)，更有操作手段。

　 朱镕基強調(diào)，在開展區(qū)域經(jīng)濟合作方面，要優(yōu)先啟動貿(mào)易投資便利化進程，制定多邊經(jīng)貿(mào)合作綱要的倡議。這有利于密切各方的經(jīng)濟聯(lián)系，使“上海合作組織”始終保持蓬勃發(fā)展的活力，也有利于我們參與全球經(jīng)濟合作與競爭，提升本國和本地區(qū)在世界政治、經(jīng)濟格局中的地位。

　 朱镕基還就深入開展六國區(qū)域經(jīng)濟合作，提出了幾點意見：一、堅持平等互利原則。二、遵循市場經(jīng)濟規(guī)則。三、循序漸進，注重實效。四、多邊與雙邊相結(jié)合。

　 六國總理在充滿相互理解、建設(shè)性和友好的氣氛中全面討論了“上海合作組織”發(fā)展和六國經(jīng)貿(mào)合作問題，并就開展經(jīng)貿(mào)、交通運輸、能源、農(nóng)業(yè)、環(huán)保、金融、水資源利用、防止森林火災等各個領(lǐng)域的合作表達了各國的關(guān)切。六國總理一致認為，發(fā)展“上海合作組織”框架內(nèi)的長期穩(wěn)定的友好合作符合六國和六國人民的根本利益，有利于推動六國關(guān)系邁上新的層次和水平。

　 六國總理在會晤中一致決定啟動六國多邊經(jīng)貿(mào)合作進程，簽署了《“上海合作組織”成員國政府間關(guān)于開展區(qū)域經(jīng)濟合作的基本目標和方向及啟動貿(mào)易和投資便利化進程的備忘錄》；宣布正式建立“上海合作組織”框架內(nèi)的總理定期會晤機制，并發(fā)表了《“上海合作組織”成員國政府總理第一次會晤新聞公報》。六國總理還發(fā)表了《“上海合作組織”成員國政府總理聲明》，對美國11日發(fā)生的恐怖行動表示極其憤慨，向美國人民及受害者表示慰問和同情，并表示“上海合作組織”準備同所有國家和國際組織密切配合，采取有效措施，為根除恐怖主義帶來的全球性危險而進行毫不妥協(xié)的斗爭。